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草地貪夜蛾染色體級別基因組公布,防治登記農藥還需多久才能出來?
來源:網絡    2019-6-24 10:24:00
    

    草地貪夜蛾是聯合國糧農組織全球預警的跨國界遷飛性農業重大害蟲,已經對全球近100個國家造成了農作物危害。今年5月,深圳華大生命科學研究院和云南農業大學共同牽頭,聯合中國科學院動物研究所、廣東省農科院、青島農業大學等多個單位共同成立研究小組,對入侵中國的“草地貪夜蛾”進行全基因組測序研究,僅用25天,從害蟲采樣到論文發表,我國首次在全球完成對這種外來入侵者染色體級別的基因測序與組裝,全球首次公布了草地貪夜蛾的高質量染色體水平的基因組,相關研究內容《Chromosome level draft genomes of the fall armyworm, Spodoptera frugiperda (Lepidoptera: Noctuidae), an alien invasive pest in China》已經于6月14日在BioRxiv上進行了預印刊載。

草地貪夜蛾染色體級別基因組公布,防治登記農藥還需多久才能出來?

    由于在當前的防治過程中發現,草地貪夜蛾有明顯的抗藥性,而我國目前還沒有防治該害蟲的登記農藥,因此草地貪夜蛾已對我國當前的農業及糧食生產安全造成了嚴重威脅。如何通過包括基因組學在內的前沿科學研究,加深對該物種的認識,從而找到根源上防治該侵入物種的關鍵路徑。雖然聯合研究組制訂的整體研究計劃還在進一步開展中,但目前在基因組測序方面取得的進展已經為該害蟲的防治工作提供了一定的可借鑒信息。在構建的草地貪夜蛾基因組上,研究團隊在該物種的12,516個基因家族發現了細胞色素p450和谷胱甘肽巰基轉移酶兩個基因家族嚴重擴張,其中細胞色素p450基因家族與解毒功能密切相關,推測主要控制其高度雜食性,而谷胱甘肽巰基轉移酶基因家族與抗藥性密切相關,推測主要驅動其農藥抗性。

草地貪夜蛾染色體級別基因組公布,防治登記農藥還需多久才能出來?

    除了解釋草地貪夜蛾高耐藥性的可能分子機制之外,基因組數據還提供了其更加精細的類別信息。已有研究表明,草地貪夜蛾包括主要以玉米為食的類型(C型)和主要以水稻為食的類型(R型),通過對本次研究目前已經測序的四個個體展開分析,研究組發現入侵中國的草地貪夜蛾種群有C和R兩種類型,確定有非洲入侵,但不排除有其他地區入侵。在測序的四只草地貪夜蛾中(2只廣東、2只云南),通過分析Tpi基因的第4外顯子的8個決定型別的分子標記,3個個體屬于C型(2個云南,1個廣東),1個個體(廣東)可能屬于R型。同時通過構建基于該基因第四外顯子的系統發育樹,也支持該鑒定結果,進一步分析結果表明屬于R型的廣東個體的單倍型為非洲特有。因此,對其型別的分析,對草地貪夜蛾的防治提出了警示,需要防范不同型別可能帶來的不同危害。

    目前,研究組完成的全球首個草地貪夜蛾染色體級別的基因組,已經在基因組數據共享平臺——國家基因庫生命大數據平臺(CNGBdb)CNP0000513 (https://db.cngb.org/cnsa/)上公開,可供研究者下載使用。高質量的基因組數據能夠加速后續科學研究,聯合研究組正在開展針對草地貪夜蛾的進一步研究,包括進一步的抗農藥分子機制研究等,同時研究組也希望同國內更多相關的科研院所進一步開展合作,充分發掘、利用基因組數據,推動草地貪夜蛾的科學防治,提高防治效率,降低其可能造成的危害。

    中國農業科學院6月17日消息中指出該院深圳農業基因組研究所的一項研究日前首次揭示出,遷飛進入我國的草地貪夜蛾群體是來源于美國佛羅里達州的地理種群。這一研究成果對我國草地貪夜蛾風險評估、精準監測和科學防控有重要指導意義。

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